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Título: Desenvolvimento de ferramentas de bioinformática para aplicação em Química Medicinal: MOLA e ChemT.
Autor: Abreu, Rui M.V.
Froufe, Hugo J.C.
Queiroz, Maria João R.P.
Ferreira, Isabel C.F.R.
Issue Date: 2011
Editora: Escola Superior Agrária de Bragança
Citação: Abreu, Rui M.V.; Froufe, Hugo J.C.; Queiroz, Maria-João R.P.; Ferreira, Isabel C.F.R. (2011) - Desenvolvimento de ferramentas de bioinformática para aplicação em Química Medicinal: MOLA e ChemT. In IV Workshop em Bioinformática. Bragança: Escola Superior Agrária
Resumo: O desenvolvimento de novas ferramentas computacionais é uma parte integral da área da bioinformática. A disponibilização destas ferramentas em modalidade de acesso livre permitir o acesso a um maior número de utilizadores e facilita significativamente o seu desenvolvimento pela facilidade de troca de ideias entre utilizadores. Neste trabalho, serão apresentados dois softwares desenvolvidos pelo nosso grupo de investigação: 1) MOLA1 que automatiza o screening virtual de bibliotecas de compostos com baixa massa molar, utilizando as ferramentas de docking AutoDock4 e AutoDock Vina; 2) ChemT2 que permite a geração de bibliotecas de compostos análogos de baixa massa molar, tendo como base uma estrutura química de interesse. Será ainda apresentado um exemplo de screening virtual utilizando a VEGFR2 (Vascular Endothelial Growth Factor Receptor 2) como proteína alvo e uma biblioteca de compostos químicos derivados de tieno[3,2-b]piridinas. Neste exemplo, o MOLA foi utilizado para automatizar o processo de screnning virtual e o ChemT para gerar a biblioteca de derivados de tieno[3,2-b]piridinas.
Arbitragem científica: yes
URI: http://hdl.handle.net/10198/6072
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