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Publicação

Desenvolvimento de ferramentas de bioinformática para aplicação em Química Medicinal: MOLA e ChemT.

dc.contributor.authorAbreu, Rui M.V.
dc.contributor.authorFroufe, Hugo J.C.
dc.contributor.authorQueiroz, Maria João R.P.
dc.contributor.authorFerreira, Isabel C.F.R.
dc.date.accessioned2011-08-31T09:47:42Z
dc.date.available2011-08-31T09:47:42Z
dc.date.issued2011
dc.description.abstractO desenvolvimento de novas ferramentas computacionais é uma parte integral da área da bioinformática. A disponibilização destas ferramentas em modalidade de acesso livre permitir o acesso a um maior número de utilizadores e facilita significativamente o seu desenvolvimento pela facilidade de troca de ideias entre utilizadores. Neste trabalho, serão apresentados dois softwares desenvolvidos pelo nosso grupo de investigação: 1) MOLA1 que automatiza o screening virtual de bibliotecas de compostos com baixa massa molar, utilizando as ferramentas de docking AutoDock4 e AutoDock Vina; 2) ChemT2 que permite a geração de bibliotecas de compostos análogos de baixa massa molar, tendo como base uma estrutura química de interesse. Será ainda apresentado um exemplo de screening virtual utilizando a VEGFR2 (Vascular Endothelial Growth Factor Receptor 2) como proteína alvo e uma biblioteca de compostos químicos derivados de tieno[3,2-b]piridinas. Neste exemplo, o MOLA foi utilizado para automatizar o processo de screnning virtual e o ChemT para gerar a biblioteca de derivados de tieno[3,2-b]piridinas.por
dc.identifier.citationAbreu, Rui M.V.; Froufe, Hugo J.C.; Queiroz, Maria-João R.P.; Ferreira, Isabel C.F.R. (2011). Desenvolvimento de ferramentas de bioinformática para aplicação em Química Medicinal: MOLA e ChemT. In IV Workshop em Bioinformática. Bragança: Escola Superior Agráriapor
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10198/6072
dc.language.isoporpor
dc.peerreviewedyespor
dc.publisherEscola Superior Agrária de Bragançapor
dc.relationSFRH/PROTEC/49450/2009
dc.relationNew antitumor and antiangiogenic heterocyclic compounds: synthesis, molecular modeling, screening of enzymatic inhibition and studies in tumor and endothelial cell lines with tyrosine kinase membrane receptors as targets
dc.titleDesenvolvimento de ferramentas de bioinformática para aplicação em Química Medicinal: MOLA e ChemT.por
dc.typeconference object
dspace.entity.typePublication
oaire.awardNumberPTDC/QUI-QUI/111060/2009
oaire.awardTitleNew antitumor and antiangiogenic heterocyclic compounds: synthesis, molecular modeling, screening of enzymatic inhibition and studies in tumor and endothelial cell lines with tyrosine kinase membrane receptors as targets
oaire.awardURIinfo:eu-repo/grantAgreement/FCT/5876-PPCDTI/PTDC%2FQUI-QUI%2F111060%2F2009/PT
oaire.citation.conferencePlaceBragançapor
oaire.citation.titleIV Workshop em Bioinformática. Escola Superior Agrária de Bragança, 27 e 28 de Abril de 2011por
oaire.fundingStream5876-PPCDTI
person.familyNameAbreu
person.familyNameFerreira
person.givenNameRui M.V.
person.givenNameIsabel C.F.R.
person.identifier144781
person.identifier.ciencia-id0F19-0DE2-12A2
person.identifier.ciencia-id9418-CF95-9919
person.identifier.orcid0000-0002-7745-8015
person.identifier.orcid0000-0003-4910-4882
person.identifier.ridE-8500-2013
person.identifier.scopus-author-id7003290613
person.identifier.scopus-author-id36868826600
project.funder.identifierhttp://doi.org/10.13039/501100001871
project.funder.nameFundação para a Ciência e a Tecnologia
rcaap.rightsopenAccesspor
rcaap.typeconferenceObjectpor
relation.isAuthorOfPublicationcadb03a4-5e60-4745-b35f-fc3a97c071bc
relation.isAuthorOfPublicationbd0d1537-2e03-41fb-b27a-140af9c35db8
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relation.isProjectOfPublication9b495104-c0da-42f7-a1cf-3dd890babd69
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