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Abstract(s)
Microorganisms are an important component of the rhizosphere, having a direct impact on soil health and crop yield. However, the factors that drive their assembly are not fully understood. Such knowledge will offer the opportunity to manipulate these microorganisms, in such a way, to increase beneficial plant-microbe interactions. Here was evaluated the effect of different soil managements on rhizospheric microorganisms of olive tree. Accordingly, within an olive orchard were collected rhizospheric soil samples from tilled and not-tilled soils and from soils with spontaneous cover vegetation or sowing, and used to analyse both bacterial and fungal community by using a culture dependent PCR-based identification approach. Overall, the bacterial community was dominated by the phylum Proteobacteria and genus Pseudomonas, while fungal community was dominated by Ascomycota and genus Penicillium. Tillage practices exhibited contrasting effects on fungal and bacterial communities, exerting a stronger influence on fungal community. Indeed, tillage showed to reduce significantly the fungal diversity and abundance, while bacterial richness was unaffected by tillage. Still, distinct fungal and bacterial community’s composition was detected among tilled vs. not tilled soils, mainly due to the exclusive presence of Mortierellaceae and Janthinobacterium in tilled soils, and Pseudogymnoascus, Solicoccozyma and Rhodococcus in not tilled soils. The cover crop had no impact on both fungal and bacterial community ́s diversity and structure. Still, a number of fungal and bacterial taxa were exclusively found either on seeded or not seeded soils. The capacity of phosphate solubilization and synthesis of indole acetic acid (IAA) of the isolates obtained was evaluated in vitro. Out of the 64 strains tested, all produced IAA and 47 were able to solubilize phosphate. The isolates showing the highest plant-growth-promoting proprieties, are potential inoculants for olive tree soils. However, the need remains to reveal the long-term effects of tillage practices and cover crop on rhizospheric bacteria and fungi composition and functionality.
Os microrganismos são um componente importante da rizosfera, tendo um impacto direto na saúde do solo e na produção das culturas. No entanto, os fatores que determinam a sua composição não se encontram esclarecidos. Este conhecimento contribuirá para a manipulação destes microrganismos, de forma a aumentar as interações benéficas planta-microrganismo. Neste estudo pretendeu-se avaliar o efeito de diferentes práticas de gestão do solo nos microrganismos rizosféricos da oliveira. Para tal, num olival foram colhidas amostras de solo rizosférico de solos mobilizados e não mobilizados e de solos com vegetação natural ou semeados, e usadas para analisar a comunidade de bactérias e fungos através de identificação molecular dos isolados obtidos em cultura. No geral, a comunidade bacteriana foi dominada pelo filo Proteobacteria e género Pseudomonas, enquanto a comunidade fúngica foi dominada por Ascomycota e género Penicillium. A mobilização do solo teve efeitos contrastantes sobre as comunidades fúngica e bacteriana, exercendo uma maior influência na comunidade fúngica. De fato, a mobilização reduziu significativamente a diversidade e abundância de fungos, enquanto que a diversidade bacteriana não foi afetada. Ainda assim, a composição da comunidade fúngica e bacteriana foi distinta entre solos mobilizados vs. não mobilizados, principalmente devido à presença exclusiva de Mortierellaceae e Janthinobacterium em solos mobilizados, e Pseudogymnoascus, Solicoccozyma e Rhodococcus em solos não mobilizados. O tipo de coberto vegetal não teve impacto na diversidade e estrutura da comunidade fúngica e bacteriana. Ainda assim, várias espécies microbianas foram detetadas exclusivamente em solos semeados ou não semeados. A capacidade de solubilização de fosfato e síntese de ácido indolacético (IAA) dos isolados obtidos foi avaliada in vitro. Das 68 estirpes testadas, todas produziram IAA e 47 solubilizaram fosfato. Os isolados que exibiram as maiores propriedades promotoras do crescimento, são potenciais fontes de inóculo para usar no olival. No entanto, fica ainda por esclarecer os efeitos a longo prazo da mobilização e do coberto vegetal na composição e funcionalidade de bactérias e fungos rizosféricos.
Os microrganismos são um componente importante da rizosfera, tendo um impacto direto na saúde do solo e na produção das culturas. No entanto, os fatores que determinam a sua composição não se encontram esclarecidos. Este conhecimento contribuirá para a manipulação destes microrganismos, de forma a aumentar as interações benéficas planta-microrganismo. Neste estudo pretendeu-se avaliar o efeito de diferentes práticas de gestão do solo nos microrganismos rizosféricos da oliveira. Para tal, num olival foram colhidas amostras de solo rizosférico de solos mobilizados e não mobilizados e de solos com vegetação natural ou semeados, e usadas para analisar a comunidade de bactérias e fungos através de identificação molecular dos isolados obtidos em cultura. No geral, a comunidade bacteriana foi dominada pelo filo Proteobacteria e género Pseudomonas, enquanto a comunidade fúngica foi dominada por Ascomycota e género Penicillium. A mobilização do solo teve efeitos contrastantes sobre as comunidades fúngica e bacteriana, exercendo uma maior influência na comunidade fúngica. De fato, a mobilização reduziu significativamente a diversidade e abundância de fungos, enquanto que a diversidade bacteriana não foi afetada. Ainda assim, a composição da comunidade fúngica e bacteriana foi distinta entre solos mobilizados vs. não mobilizados, principalmente devido à presença exclusiva de Mortierellaceae e Janthinobacterium em solos mobilizados, e Pseudogymnoascus, Solicoccozyma e Rhodococcus em solos não mobilizados. O tipo de coberto vegetal não teve impacto na diversidade e estrutura da comunidade fúngica e bacteriana. Ainda assim, várias espécies microbianas foram detetadas exclusivamente em solos semeados ou não semeados. A capacidade de solubilização de fosfato e síntese de ácido indolacético (IAA) dos isolados obtidos foi avaliada in vitro. Das 68 estirpes testadas, todas produziram IAA e 47 solubilizaram fosfato. Os isolados que exibiram as maiores propriedades promotoras do crescimento, são potenciais fontes de inóculo para usar no olival. No entanto, fica ainda por esclarecer os efeitos a longo prazo da mobilização e do coberto vegetal na composição e funcionalidade de bactérias e fungos rizosféricos.
Description
Keywords
Tillage Soil cover vegetation Bacteria Fungi Plant growth promoting microorganisms