Publication
Temporal dynamics of endophytic microbial communities colonizing olives infested and non-infested by olive fruit fly
| datacite.subject.fos | Ciências Agrárias::Biotecnologia Agrária e Alimentar | pt_PT |
| dc.contributor.advisor | Baptista, Paula | |
| dc.contributor.advisor | Ramos, Vítor Manuel Capela | |
| dc.contributor.author | Lopes, Teresa | |
| dc.date.accessioned | 2021-01-07T10:08:46Z | |
| dc.date.available | 2021-01-07T10:08:46Z | |
| dc.date.issued | 2020 | |
| dc.date.submitted | 2019 | |
| dc.description.abstract | Olive fruit fly, Bactrocera oleae (Rossi) (Diptera: Tephritidae) is the major insect pest of olive crop worldwide. Distinct olive cultivars exhibit different susceptibility to olive fruit fly infestation and the causes of this phenomenon are still unclear. Here, we wanted to disclose the role of biotic and abiotic factors in shaping the olive-associated endophytes and their implication in conferring different host susceptibilities to olive fly. The importance of air as a source of endophytes was additionally evaluated. Accordingly, the endophytic microbial composition of infested and non-infested fruits from cultivars Madural (susceptible to olive fly) and Cobrançosa (less susceptible) were studied over two maturation indexes in two olive orchards under organic and integrated management. Endophytic diversity assessed by rRNA sequencing of cultivable isolates revealed a larger consortium of bacteria associated to olives than fungi. The bacterial communities were predominantly composed of Proteobacteria and Actinobacteria while the fungal community was dominated by members belonging to Ascomycota. The overall assemblages of endophytes in fruits were shaped mainly by the maturation index, followed by the type of management and cultivar, being the level of infestation a negligible effect. Despite this, it was found a clear positive association of a set of endophytes with the resistant cultivar (Pseudomonas citronellolis, Rhodococcus fascians, Actinobacterium sp., Cladosporium sp. 2, Stereum sp. and Aspergillus flavus), organic orchard and non-infested fruits (Microbacterium paraoxydans, Kocuria sp., Penicillium solitum, Cladosporium sp3. and Vishniacozyma victoriae). The microbial composition of the air and the fruit endosphere were completely different, suggesting that there are other sources of endophytes. Our study provides potential microbial candidates to further evaluate their role on host cultivar susceptibility/resistance to fruit fly. | pt_PT |
| dc.description.abstract | A mosca da azeitona, Bactrocera oleae (Rossi) (Diptera: Tephritidae), é a praga mais importante da oliveira a nível mundial. Existem cultivares com diferentes graus de suscetibilidade à infestação pela mosca da azeitona e as causas deste fenômeno ainda não são claras. Neste trabalho, pretende-se estudar a influência de fatores bióticos e abióticos na estrutura e composição de endófitos da azeitona, e de que modo estes podem conferir diferenças de suscetibilidade nas cultivares. Adicionalmente, pretende-se avaliar a importância do ar como fonte de endófitos. Para tal, estudou-se a composição microbiana endofítica de azeitonas infestadas e não infestadas das cultivares Madural (susceptível à mosca da azeitona) e Cobrançosa (menos susceptível) ao longo de dois índices de maturação em dois olivais conduzidos em modo de produção biológico e integrado. A comunidade endofítica dos frutos avaliada através da sequenciação de rRNA de isolados cultiváveis, revelou uma maior abundância de bactérias face aos fungos. A comunidade bacteriana foi dominada por membros dos filos Proteobacteria e Actinobacteria, enquanto os fungos pertenciam maioritariamente ao filo Ascomycota. No geral, a composição da comunidade endofitica foi influenciada principalmente pelo índice de maturação, seguido pelo modo de produção e cultivar, tendo o nível de infestação um efeito reduzido. No entanto, foi identificado um conjunto de endófitos positivamente associados à cultivar resistente (Pseudomonas citronellolis, Rhodococcus fascians, Actinobacterium sp., Cladosporium sp. 2, Stereum sp. e Aspergillus flavus), ao modo de produção biológico e azeitonas não infestadas (Microbacterium paraoxydans, Kocuria sp., Penicillium solitum, Cladosporium sp3. e Vishniacozyma victoriae). A composição microbiana do ar e da endosfera dos frutos foram completamente diferentes, sugerindo que existem outras fontes de endófitos. No geral, este estudo fornece potenciais candidatos microbianos para avaliar melhor no futuro o seu papel na suscetibilidade / resistência da cultivar à mosca da azeitona. | pt_PT |
| dc.description.sponsorship | This work is supported by FEDER funds through the COMPETE (Operational Program for Competitiveness Factors) and by National funds through the FCT (Foundation for Science and Technology) in the scope of the project POCI-01-0145-FEDER-031133 “MicOlives - Exploiting plant induced resistance by beneficial fungi as a new sustainable approach to olive crop protection”. | pt_PT |
| dc.identifier.tid | 202573559 | pt_PT |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10198/23055 | |
| dc.language.iso | eng | pt_PT |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ | pt_PT |
| dc.subject | Bactrocera oleae Rossi | pt_PT |
| dc.subject | Susceptibility of olive cultivars | pt_PT |
| dc.subject | Endophytes | pt_PT |
| dc.subject | Orchard management | pt_PT |
| dc.subject | Maturation index | pt_PT |
| dc.subject | Airborne microorganisms | pt_PT |
| dc.title | Temporal dynamics of endophytic microbial communities colonizing olives infested and non-infested by olive fruit fly | pt_PT |
| dc.type | master thesis | |
| dspace.entity.type | Publication | |
| person.familyName | Lopes | |
| person.givenName | Teresa | |
| person.identifier.ciencia-id | F310-3730-8A92 | |
| rcaap.rights | restrictedAccess | pt_PT |
| rcaap.type | masterThesis | pt_PT |
| relation.isAuthorOfPublication | f58bdffc-33af-46fe-8525-7f83904fcb52 | |
| relation.isAuthorOfPublication.latestForDiscovery | f58bdffc-33af-46fe-8525-7f83904fcb52 | |
| thesis.degree.name | Engenharia Biotecnológica | pt_PT |
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