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Fatores moleculares no metabolismo fundamental de Phytophthora cinnamomi

2021Journal article Open access
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dc.contributor.authorRibeiro, Daniel
dc.contributor.authorBranco, Iuliia
dc.contributor.authorChoupina, Altino
dc.date.accessioned2022-02-14T11:38:08Z
dc.date.available2022-02-14T11:38:08Z
dc.date.issued2021
dc.description.abstractPhytophthora cinnamomi é um Oomiceta diploide que vive no solo e é o causador da morte de inúmeras plantas em todo o mundo. Em Portugal a produção de castanheiro europeu encontra-se sobretudo na região norte onde mais de 80% está concentrada principalmente na região de Trás-os-Montes, tornando-se uma fonte económica muito valiosa para a região. A doença da tinta do castanheiro europeu é uma patologia causada principalmente por P. cinnamomi e representa uma ameaça para a preservação do castanheiro europeu (Castanea sativa Miller). O principal objetivo deste trabalho é a identificação de genes que expressam proteínas relacionadas com o metabolismo fundamental de P. cinnamomi, através da utilização de ferramentas bioinformáticas. O genoma deste microrganismo encontra-se depositado na base de dados biológicos NCBI (National Center for Biotechnology Information) e através das sequências desse genoma foram identificadas as ORFs (open reading frames - fases de leitura aberta) que codifiquem para proteínas associadas ao metabolismo fundamental. Com ferramentas bioinformáticas conseguimos ainda predizer a localização subcelular, a estrutura tridimensional, as características físico-químicas e a caracterização dos domínios dessas proteínas.pt_PT
dc.description.abstractPhytophthora cinnamomi is a diploid Oomycete that lives in the soil and is the cause of the death of countless plants worldwide. In Portugal the production of European chestnut is found mainly in the northern region where more than 80% is concentrated mainly in the region of Trás-os-Montes, making it a very valuable economic source for the region. European chestnut ink disease is a pathology caused mainly by P. cinnamomi and poses a threat to the preservation of chestnut (Castanea sativa Miller). The main objective of this work is the identification of genes that express proteins related to the fundamental metabolism of P. cinnamomi, using bioinformatics tools. The genome of this microorganism is deposited in the biological database NCBI (National Center for Biotechnology Information) and through the sequences of this genome, ORFs (open reading frames) that code for proteins associated with fundamental metabolism were identified. With bioinformatics tools we can also predict the subcellular location, the three-dimensional structure, the physical-chemical characteristics and the characterization of the domains of these proteins.pt_PT
dc.description.versioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersionpt_PT
dc.identifier.citationFatores moleculares no metabolismo fundamental de Phytophthora cinnamomi = Molecular factors in the fundamental metabolism of Phytophthora cinnamomi Ribeiro, Daniel; Branco, Iuliia; Choupina, Altino (2021). Revista de Ciências Agrárias. ISSN 0871-018X. 44:2-3, p. 203-214pt_PT
dc.identifier.doi10.19084/rca.24616pt_PT
dc.identifier.issn0871-018X
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10198/25057
dc.language.isoporpt_PT
dc.peerreviewedyespt_PT
dc.publisherSiciedade de Ciências Agrárias de Portugal (SCAP)pt_PT
dc.relation.ispartofseries44;
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/pt_PT
dc.subjectPhytophthora cinnamomipt_PT
dc.subjectBases de dadospt_PT
dc.subjectMetabolismo fundamentalpt_PT
dc.subjectBioinformáticapt_PT
dc.titleFatores moleculares no metabolismo fundamental de Phytophthora cinnamomipt_PT
dc.title.alternativeMolecular factors in the fundamental metabolism of Phytophthora cinnamomipt_PT
dc.typejournal article
dspace.entity.typePublication
oaire.citation.conferencePlaceLisboapt_PT
oaire.citation.endPage214pt_PT
oaire.citation.issue2-3pt_PT
oaire.citation.startPage203pt_PT
oaire.citation.titleRevista de Ciências Agráriaspt_PT
oaire.citation.volume44pt_PT
person.familyNameChoupina
person.givenNameAltino
person.identifier587972
person.identifier.ciencia-id1A14-77FC-9656
person.identifier.orcid0000-0002-3956-9398
person.identifier.ridL-5382-2014
person.identifier.scopus-author-id14051602500
rcaap.rightsopenAccesspt_PT
rcaap.typearticlept_PT
relation.isAuthorOfPublication314b895b-a5e2-4a92-9bc6-dd708c819be4
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