Browsing by Author "Bienefeld, Kaspar"
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- Apiário teste do SMARTBEES instalado e avaliado pelo Instituto Politécnico de Bragança: resultados de um ano de avaliaçãoPublication . Neves, Cátia J.; Ventura, Paulo J.C.; Uzunov, Aleksandar; Büchler, Ralph; Bienefeld, Kaspar; Pinto, M. AliceO projecto Europeu FP7 intitulado “Gestão sustentável de populações resilientes de abelha melífera” (“Sustainable Management of Resilient Bee Populations”), com o acrónimo “SMARTBEES”, teve início a 1 de novembro de 2014. As atividades de investigação do SMARTBEES abrangem toda a Europa e estão distribuídas por nove Ações. A Ação 6, intitulada “Testes de campo e seleção de populações locais de abelhas” (“Field testing and selection of local bee populations”) e coordenada pelo Instituto da Abelha em Kirchhain, Alemanha, é particularmente interessante para os apicultores de toda a Europa. No âmbito da Ação 6 estão a ser testadas colónias de diferentes subespécies Europeias relativamente às características apícolas tradicionais as quais incluem a produção de mel, a docilidade e o enxameamento. Para além destas, estão também a ser avaliadas características associadas à resistência à varroa, incluindo comportamento higiénico, comportamento de “grooming”, e VSH (“Varroasensitive hygiene”), entre outras. A colaboração de Portugal na Ação 6 teve início no outono de 2015 com a instalação de quatro apiários teste (Nisa, Leria, Castelo Branco e Bragança). Neste artigo são apresentados os resultados obtidos no período de outubro de 2015 a setembro 2016, no apiário teste do Instituto Politécnico de Bragança (IPB).
- Complex population structure and haplotype patterns in the Western European honey bee from sequencing a large panel of haploid dronesPublication . Wragg, David; Eynard, Sonia E.; Basso, Benjamin; Canale‐Tabet, Kamila; Labarthe, Emmanuelle; Bouchez, Olivier; Bienefeld, Kaspar; Bieńkowska, Małgorzata; Costa, Cecilia; Gregorc, Aleš; Kryger, Per; Parejo, Melanie; Pinto, M. Alice; Bidanel, Jean‐Pierre; Servin, Bertrand; Le Conte, Yves; Vignal, AlainHoney bee subspecies originate from specific geographical areas in Africa, Europe and the Middle East, and beekeepers interested in specific phenotypes have imported genetic material to regions outside of the bees' original range for use either in pure lines or controlled crosses. Moreover, imported drones are present in the environ-ment and mate naturally with queens from the local subspecies. The resulting ad-mixture complicates population genetics analyses, and population stratification can be a major problem for association studies. To better understand Western European honey bee populations, we produced a whole genome sequence and single nucleotide polymorphism (SNP) genotype data set from 870 haploid drones and demonstrate its utility for the identification of nine genetic backgrounds and various degrees of admixture in a subset of 629 samples. Five backgrounds identified correspond to sub-species, two to isolated populations on islands and two to managed populations. We also highlight several large haplotype blocks, some of which coincide with the position of centromeres. The largest is 3.6 Mb long and represents 21% of chromosome 11, with two major haplotypes corresponding to the two dominant genetic backgrounds identified. This large naturally phased data set is available as a single vcf file that can now serve as a reference for subsequent populations genomics studies in the honey bee, such as (i) selecting individuals of verified homogeneous genetic backgrounds as references, (ii) imputing genotypes from a lower-density data set generated by an SNP- chip or by low- pass sequencing, or (iii) selecting SNPs compatible with the re-quirements of genotyping chips.
- O programa de seleção e melhoramento genético do SMARTBEES na Europa e em Portugal – o testemunho de uma experiência de dois anos.Publication . Pinto, M. Alice; Uzunov, Aleksandar; Büchler, Ralph; Bienefeld, KasparNo momento em que o projeto SMARTBEES (www.smartbees.eu) ultrapassou metade da sua duração, relata-se o que foi feito até aqui e os desafios que se foram enfrentando durante a implementação deste projeto de investigação pan-europeu de quatro anos. O projecto abrange uma vasta gama de áreas de investigação associadas à saúde das abelhas e à apicultura, tais como genómica molecular, fisiologia, parasitologia, virologia, taxonomia e extensão. Um dos objectivos centrais do SMARTBEES é aprofundar o conhecimento da diversidade genética natural das populações europeias, como ponto de partida para a sua preservação através da selecção de colónias resistentes e adaptadas às condições locais. Sob a liderança do Instituto da Abelha Melífera em Kirchhain, Alemanha, e com o apoio inestimável de numerosos participantes, foram levadas a cabo ações para se iniciar e promover por toda a Europa o melhoramento genético das populações locais de abelha melífera, com especial enfase nas mais negligenciadas e ameaçadas. Assim, desde a Primavera de 2015, foram realizados mais de 20 workshops e sessões de treino em apiários distribuídos por toda a Europa (Fig. 1). Mais de 320 criadores de rainhas e apicultores foram treinados na aplicação dos métodos e instrumentos padronizados de selecção e teste de rainhas (Fig. 2). A metodologia que tem sido utilizada segue os requisitos da plataforma BEEBREED (www. beebreed.eu), a mais proeminente no mundo no que diz respeito à estimativa de valores reprodutivos das várias características sob seleção.