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Experiências computacionais na optimização do processo de fermentação da E. Coli usando o Optferm

dc.contributor.authorTeixeira, Tânia
dc.contributor.authorDeusdado, Sérgio
dc.date.accessioned2011-05-16T15:44:47Z
dc.date.available2011-05-16T15:44:47Z
dc.date.issued2011
dc.description.abstractNas últimas duas décadas, fruto do desenvolvimento acelerado da investigação em biologia molecular, a quantidade de dados genómicos, proteómicos, metabolómicos e filogenéticos cresceu exponencialmente, obrigando os investigadores ao recurso a ferramentas computacionais para armazenar, comunicar e tratar os dados biológicos descobertos. Em consequência, a bioinformática tem emergido desta necessidade para dar resposta às questões de gestão da bioinformação, bem como servindo de auxiliar da inferência de conhecimento que leva à compreensão funcional. A necessidade de incluir, adaptar e maximizar a produtividade de bioprocessos em diferentes indústrias biotecnológicas originou um elevado interesse em programas informáticos que possam auxiliar na optimização das produções biotecnológicas que recorrem a microrganismos. Neste âmbito, têm sido desenvolvidos vários programas, que permitem modelar, simular e optimizar in silico alguns bioprocessos. Neste seguimento, foi feito um estudo do estado de arte das ferramentas existentes no sentido de seleccionar fundamentadamente a(s) fermenta(s) mais adequadas para este trabalho. O OptFerm é um software que integra um conjunto variado de algoritmos de IA, nomeadamente baseados em redes neuronais artificiais, com o objectivo de auxiliar a optimização de bioprocessos de fermentação. É uma ferramenta de fácil utilização, modular, programado em linguagem Java, e que permite a realização de várias tarefas de simulação, optimização e estimação de parâmetros com diferentes condições no que refere a variáveis de estado, parâmetros, perfis de alimentação, entre outros, usados em bioreactores do tipo fed-batch. Numa tentativa de testar a aplicabilidade e a eficiência do software, foram efectuados testes, usando o OptFerm, tendo como modelo o processo fermentativo da Escherichia cole. Recolheram-se os resultados experimentais produzidos pelos algoritmos baseados nas diferentes técnicas de IA e compararam-se os seus desempenhos. Finalmente, fez-se uma análise comparativa no sentido de validar as metodologias usadas face aos resultados obtidos em laboratório usando bioreactores físicos.por
dc.identifier.citationTeixeira, Tânia; Deusdado, Sérgio (2011). Experiências computacionais na optimização do processo de fermentação da E. Coli usando o Optferm. In 4º Edição do Workshop em Bioinformática. Bragançapor
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10198/4318
dc.language.isoporpor
dc.publisherInstituto Politécnico de Bragança, Escola Superior Agráriapor
dc.subjectOptimização de bioprocessospor
dc.subjectBioinformáticapor
dc.subjectOptfermpor
dc.subjectFermentação e. colipor
dc.titleExperiências computacionais na optimização do processo de fermentação da E. Coli usando o Optfermpor
dc.typeconference object
dspace.entity.typePublication
oaire.citation.conferencePlaceBragança, Portugalpor
oaire.citation.titleIV Workshop em Bioinformática da ESApor
person.familyNameDeusdado
person.givenNameSérgio
person.identifier.ciencia-id1D14-2CBC-54F2
person.identifier.orcid0000-0003-2638-2230
person.identifier.scopus-author-id15764598600
rcaap.rightsopenAccesspor
rcaap.typeconferenceObjectpor
relation.isAuthorOfPublication1363c41f-0861-40ea-a87a-4a24d9658f03
relation.isAuthorOfPublication.latestForDiscovery1363c41f-0861-40ea-a87a-4a24d9658f03

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