Publication
Adaptação local na abelha ibérica
dc.contributor.author | Henriques, Dora | |
dc.contributor.author | Wallberg, Andreas | |
dc.contributor.author | Chávez-Galarza, Julio | |
dc.contributor.author | Neves, Cátia J. | |
dc.contributor.author | Costa, Filipe Oliveira | |
dc.contributor.author | Webster, Matthew T. | |
dc.contributor.author | Pinto, M. Alice | |
dc.date.accessioned | 2018-10-09T09:52:18Z | |
dc.date.available | 2018-10-09T09:52:18Z | |
dc.date.issued | 2016 | |
dc.description.abstract | Perceber a base genética do processo de adaptação permite uma previsão de como os organismos poderão responder a mudanças ambientais. A sequenciação de genomas a baixo custo, juntamente com os avanços das ferramentas estatísticas e computacionais possibilitam a compreensão da base genética da adaptação. O objectivo deste trabalho é o estudo da adaptação local da abelha ibérica, tendo como base algoritmos que permitem a incorporação de dados genéticos e ambientais. A Península Ibérica constituiu um local de interesse para este tipo de estudos por ser constituída por uma diversidade climática como Mediterrânico e Atlântico. Foram sequenciados 86 genomas de indivíduos distribuídos em 3 transectos (Atlântico, Central e Mediterrâneo) de forma a representar a diversidade climática existente na Península Ibérica. Em cada ponto de amostragem os dados de latitude e longitude foram recolhidos e variáveis ambientais foram retiradas das bases de dados WorldClim e Climatic Research Unit. Os métodos LFMM e Samβada, que integram informação genética e ambiental foram utilizados para procurar sinais de selecção. A vantagem destes métodos é que se pode perceber quais as variáveis ambientais que exercem uma pressão selectiva e que genes estão associados a cada variável. No total foram identificados 1289449 SNPs, dos quais 2193 mostraram estar significativamente associados com variáveis ambientais. Estes estão localizados em 826 genes. No conjunto das variáveis ambientais utilizadas, a longitude, latitude e precipitação apresentaram um maior num de SNPs associados. Foram encontrados genes com diversas funções, por exemplo quatro genes parecem relacionados com o desenvolvimento do sistema imunitário e este encontram associados à longitude, para a latitude proteínas de ligação parecem ser predominantes, já na precipitação aparecem genes relacionados com a morfogénese, actividade transportadora transmembranar e actividade olfactória. Este estudo representa primeira tentativa de compreender a base genética da adaptação local a partir de genomas completos. | pt_PT |
dc.description.sponsorship | Agradecemos aos numerosos apicultores e técnicos de associações e também a A. Pajuelo, Andreia Brandão, Inês Moura, Margarida Neto, Irene Munoz, Pilar de la Rua, João C. Azevedo, e João Paulo Castro pela colaboração na amostragem. DH e JCG são financiados pela FCT através das bolsas de doutoramento SFRH/BD/84195/2012 e SFRH/BD/68682/2010, respetivamente. Este estudo foi financiado pelo projeto PTDC/BIA-BEC/099640/2008 (Fundação Ciência e Tecnologia, FCT, e COMPETE/QREN/EU). Cátia Neves é financiada através do concurso conjunto 2013-2014 BiodivErsA/FACCE-JPI, com a Fundação para a Ciência e Tecnologia como financiador nacional. As analises bioinformáticas foram efetuadas usando os recursos do "Uppsala Multidisciplinary Center for Advanced Computational Science (UPPMAX)", Universidade de Uppsala, Suécia. | pt_PT |
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dc.identifier.citation | Henriques, Dora; Wallberg, Andreas; Chávez-Galarza, Julio; Neves, Cátia; Costa, Filipe O.; Webster, Matthew T.; Pinto, M. Alice (2016). Adaptação local na abelha ibérica. In IV Congresso Ibérico de Apicultura. Salamanca. | pt_PT |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10198/18023 | |
dc.language.iso | por | pt_PT |
dc.peerreviewed | yes | pt_PT |
dc.relation | POPULATION GENOMICS AND LANDSCAPE GENETICS OF THE IBERIAN HONEY BEE APIS MELLIFERA IBERIENSIS | |
dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ | pt_PT |
dc.subject | Seleção | pt_PT |
dc.subject | Apis mellifera | pt_PT |
dc.title | Adaptação local na abelha ibérica | pt_PT |
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oaire.citation.title | IV Congresso Ibérico de Apicultura | pt_PT |
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