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Publicação

Adaptação local na abelha ibérica

dc.contributor.authorHenriques, Dora
dc.contributor.authorWallberg, Andreas
dc.contributor.authorChávez-Galarza, Julio
dc.contributor.authorNeves, Cátia J.
dc.contributor.authorCosta, Filipe Oliveira
dc.contributor.authorWebster, Matthew T.
dc.contributor.authorPinto, M. Alice
dc.date.accessioned2018-10-09T09:52:18Z
dc.date.available2018-10-09T09:52:18Z
dc.date.issued2016
dc.description.abstractPerceber a base genética do processo de adaptação permite uma previsão de como os organismos poderão responder a mudanças ambientais. A sequenciação de genomas a baixo custo, juntamente com os avanços das ferramentas estatísticas e computacionais possibilitam a compreensão da base genética da adaptação. O objectivo deste trabalho é o estudo da adaptação local da abelha ibérica, tendo como base algoritmos que permitem a incorporação de dados genéticos e ambientais. A Península Ibérica constituiu um local de interesse para este tipo de estudos por ser constituída por uma diversidade climática como Mediterrânico e Atlântico. Foram sequenciados 86 genomas de indivíduos distribuídos em 3 transectos (Atlântico, Central e Mediterrâneo) de forma a representar a diversidade climática existente na Península Ibérica. Em cada ponto de amostragem os dados de latitude e longitude foram recolhidos e variáveis ambientais foram retiradas das bases de dados WorldClim e Climatic Research Unit. Os métodos LFMM e Samβada, que integram informação genética e ambiental foram utilizados para procurar sinais de selecção. A vantagem destes métodos é que se pode perceber quais as variáveis ambientais que exercem uma pressão selectiva e que genes estão associados a cada variável. No total foram identificados 1289449 SNPs, dos quais 2193 mostraram estar significativamente associados com variáveis ambientais. Estes estão localizados em 826 genes. No conjunto das variáveis ambientais utilizadas, a longitude, latitude e precipitação apresentaram um maior num de SNPs associados. Foram encontrados genes com diversas funções, por exemplo quatro genes parecem relacionados com o desenvolvimento do sistema imunitário e este encontram associados à longitude, para a latitude proteínas de ligação parecem ser predominantes, já na precipitação aparecem genes relacionados com a morfogénese, actividade transportadora transmembranar e actividade olfactória. Este estudo representa primeira tentativa de compreender a base genética da adaptação local a partir de genomas completos.pt_PT
dc.description.sponsorshipAgradecemos aos numerosos apicultores e técnicos de associações e também a A. Pajuelo, Andreia Brandão, Inês Moura, Margarida Neto, Irene Munoz, Pilar de la Rua, João C. Azevedo, e João Paulo Castro pela colaboração na amostragem. DH e JCG são financiados pela FCT através das bolsas de doutoramento SFRH/BD/84195/2012 e SFRH/BD/68682/2010, respetivamente. Este estudo foi financiado pelo projeto PTDC/BIA-BEC/099640/2008 (Fundação Ciência e Tecnologia, FCT, e COMPETE/QREN/EU). Cátia Neves é financiada através do concurso conjunto 2013-2014 BiodivErsA/FACCE-JPI, com a Fundação para a Ciência e Tecnologia como financiador nacional. As analises bioinformáticas foram efetuadas usando os recursos do "Uppsala Multidisciplinary Center for Advanced Computational Science (UPPMAX)", Universidade de Uppsala, Suécia.pt_PT
dc.description.versioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersionpt_PT
dc.identifier.citationHenriques, Dora; Wallberg, Andreas; Chávez-Galarza, Julio; Neves, Cátia; Costa, Filipe O.; Webster, Matthew T.; Pinto, M. Alice (2016). Adaptação local na abelha ibérica. In IV Congresso Ibérico de Apicultura. Salamanca.pt_PT
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10198/18023
dc.language.isoporpt_PT
dc.peerreviewedyespt_PT
dc.relationCentros de conservação da abelha melífera na Europa Ocidental: uma estratégia inovadora através de uma apicultura sustentável para reduzir declínio da abelha
dc.relationPopulation genomics and landscape genetics of the iberian honey bee Apis mellifera iberiensis
dc.relationGenomic phylogeography and demographic history of the Iberian honeybee (Apis mellifera iberiensis)
dc.relationPadrões e processos de variação (neutral e adaptativa) na zona de hibridação da abelha (Apis mellifera iberiensis) da Península Ibérica: uma abordagem de genética de populações integrando genómica populacional e genética da paisagem
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/pt_PT
dc.subjectSeleçãopt_PT
dc.subjectApis melliferapt_PT
dc.titleAdaptação local na abelha ibéricapt_PT
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dspace.entity.typePublication
oaire.awardNumberBiodivERsA/0002/2014
oaire.awardNumberSFRH/BD/68682/2010
oaire.awardNumberSFRH/BD/84195/2012
oaire.awardNumberPTDC/BIA-BEC/099640/2008
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oaire.awardTitleGenomic phylogeography and demographic history of the Iberian honeybee (Apis mellifera iberiensis)
oaire.awardTitlePadrões e processos de variação (neutral e adaptativa) na zona de hibridação da abelha (Apis mellifera iberiensis) da Península Ibérica: uma abordagem de genética de populações integrando genómica populacional e genética da paisagem
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oaire.citation.conferencePlaceSalamancapt_PT
oaire.citation.titleIV Congresso Ibérico de Apiculturapt_PT
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person.identifier.orcid0000-0001-7530-682X
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