Publication
VScore: uma plataforma para desenvolvimento de novos fármacos usando screening virtual
| dc.contributor.author | Froufe, Hugo J.C. | |
| dc.contributor.author | Ferreira, Isabel C.F.R. | |
| dc.contributor.author | Sousa, João N. | |
| dc.contributor.author | Rufino, José | |
| dc.contributor.author | Abreu, Rui M.V. | |
| dc.date.accessioned | 2013-09-13T08:45:02Z | |
| dc.date.available | 2013-09-13T08:45:02Z | |
| dc.date.issued | 2013 | |
| dc.description.abstract | O screening virtual de grandes bibliotecas de compostos químicos, utilizando metodologias computacionais como o molecular docking, é cada vez mais utilizado na procura de potenciais inibidores de proteínas-alvo envolvidas em diferentes patologias. No entanto, devido ao facto destas bibliotecas poderem atingir um número de compostos químicos que podem ir das dezenas às centenas de milhar, é muitas vezes necessária a utilização de clusters de computadores de Alto Desempenho Computacional (HPC – High Througoutput Computing), bem como de ferramentas de criação, gestão e acesso de bibliotecas de compostos químicos (2). Neste contexto, desenvolvemos o VScore (Virtual Screening core), uma plataforma computacional que permite a gestão de grandes projetos de Screening Virtual. O VScore utiliza o AutoDock4 e/ou o AutoDock Vina (1) como ferramentas de docking e inclui várias ferramentas avançadas de criação e gestão de bilbiotecas de compostos químicos. Entre as principais características avançadas estão incluidas a automatização e paralelização de todos os ensaios de docking, bem com a automatização da análise e visualização de resultados e a possiblidade de gerir facilmente grandes bibliotecas de compostos e estruturas 3D de proteínas. O VScore será disponibilizado livremente para a comunidade académica, estando a ser estudado um modelo para desenvolvimento futuro acente num regime de donativos de futuros utilizadores. | por |
| dc.identifier.citation | Froufe, Hugo J.C.; Ferreira, Isabel C.F.R.; Sousa, João N.; Amaro, José C.R.; Abreu, Rui M.V. (2013). VScore: uma plataforma para desenvolvimento de novos fármacos usando screening virtual. In V Workshop em Bioinformática. Bragança | por |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10198/8744 | |
| dc.language.iso | por | por |
| dc.publisher | Instituto Politécnico de Bragança, Escola Superior Agrária | por |
| dc.title | VScore: uma plataforma para desenvolvimento de novos fármacos usando screening virtual | por |
| dc.type | conference object | |
| dspace.entity.type | Publication | |
| oaire.citation.conferencePlace | Bragança | por |
| oaire.citation.title | V Workshop em Bioinformática. Escola Superior Agrária de Bragança, 15 e 16 de Maio de 2013 | por |
| person.familyName | Ferreira | |
| person.familyName | Rufino | |
| person.familyName | Abreu | |
| person.givenName | Isabel C.F.R. | |
| person.givenName | José | |
| person.givenName | Rui M.V. | |
| person.identifier | 144781 | |
| person.identifier.ciencia-id | 9418-CF95-9919 | |
| person.identifier.ciencia-id | C414-F47F-6323 | |
| person.identifier.ciencia-id | 0F19-0DE2-12A2 | |
| person.identifier.orcid | 0000-0003-4910-4882 | |
| person.identifier.orcid | 0000-0002-1344-8264 | |
| person.identifier.orcid | 0000-0002-7745-8015 | |
| person.identifier.rid | E-8500-2013 | |
| person.identifier.scopus-author-id | 36868826600 | |
| person.identifier.scopus-author-id | 55947199100 | |
| person.identifier.scopus-author-id | 7003290613 | |
| rcaap.rights | openAccess | por |
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