Utilize este identificador para referenciar este registo: http://hdl.handle.net/10198/8744
Título: VScore: uma plataforma para desenvolvimento de novos fármacos usando screening virtual
Autor: Froufe, Hugo J.C.
Ferreira, Isabel C.F.R.
Sousa, João N.
Amaro, José C.R.
Abreu, Rui M.V.
Data: 2013
Editora: Instituto Politécnico de Bragança, Escola Superior Agrária
Citação: Froufe, Hugo J.C.; Ferreira, Isabel C.F.R.; Sousa, João N.; Amaro, José C.R.; Abreu, Rui M.V. (2013) - VScore: uma plataforma para desenvolvimento de novos fármacos usando screening virtual. In V Workshop em Bioinformática. Bragança
Resumo: O screening virtual de grandes bibliotecas de compostos químicos, utilizando metodologias computacionais como o molecular docking, é cada vez mais utilizado na procura de potenciais inibidores de proteínas-alvo envolvidas em diferentes patologias. No entanto, devido ao facto destas bibliotecas poderem atingir um número de compostos químicos que podem ir das dezenas às centenas de milhar, é muitas vezes necessária a utilização de clusters de computadores de Alto Desempenho Computacional (HPC – High Througoutput Computing), bem como de ferramentas de criação, gestão e acesso de bibliotecas de compostos químicos (2). Neste contexto, desenvolvemos o VScore (Virtual Screening core), uma plataforma computacional que permite a gestão de grandes projetos de Screening Virtual. O VScore utiliza o AutoDock4 e/ou o AutoDock Vina (1) como ferramentas de docking e inclui várias ferramentas avançadas de criação e gestão de bilbiotecas de compostos químicos. Entre as principais características avançadas estão incluidas a automatização e paralelização de todos os ensaios de docking, bem com a automatização da análise e visualização de resultados e a possiblidade de gerir facilmente grandes bibliotecas de compostos e estruturas 3D de proteínas. O VScore será disponibilizado livremente para a comunidade académica, estando a ser estudado um modelo para desenvolvimento futuro acente num regime de donativos de futuros utilizadores.
URI: http://hdl.handle.net/10198/8744
Aparece nas colecções:BB - Resumos em Proceedings Não Indexados ao ISI/Scopus

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