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Título: BBMS++ – metapesquisador bioinformático
Autor: Carocho, Márcio
Deusdado, Sérgio
Palavras-chave: Meta-pesquisador
Bioinformática
Issue Date: 2011
Editora: Instituto Politécnico de Bragança, Escola Superior Agrária
Citação: Carocho, Márcio; Deusdado, Sérgio (2011) - BBMS++ – metapesquisador bioinformático. In 4º Edição do Workshop em Bioinformática. Bragança
Resumo: Neste artigo descreve-se a criação implementação de um meta-pesquisador [1-7] na área da bioinformática (BBMS – Basic Bioinformatics Meta-searcher), desenvolvido de raiz na língua portuguesa. O BBMS permite um acesso centralizado aos motores de busca online das principais bases de dados biológicos primárias, bastante fácil de entender e que permite aceder a informação biológica contida nas mais importantes bases de dados públicas mundiais, sem que, para isso o utilizador tenha que sair do “website” desenvolvido. O BBMS tem sido actualizado para abranger um maior leque de frontes de bioinformação, mas centra-se mormente em nucleótidos, proteínas e vias metabólicas [8,9]. Adicionalmente, o BBMS também pesquisa bibliografia científica nas principais publicações de índole bioinformática. O programa é autónomo, apenas é necessário introduzir as palavras-chave da pesquisa e apontar para que base de dados a pesquisa deve ser feita. Por defeito, os resultados são disponibilizados em Inglês, mas um painel de tradução, incorporado no nosso meta-pesquisador, permite que estes sejam traduzidos para várias línguas, incluindo o Português, em tempo real e sem demoras. Outro aspecto importante é a pesquisa global na Internet, que pode ser utilizada quando o utilizador não sabe onde procurar especificamente. Deste modo, o meta-pesquisador BBMS realiza a pesquisa em bases de dados, motores de busca específicos, bancos de imagens e vídeos, entre outros locais relevantes. Para esta operação, baseia-se no funcionamento do “Bioinformatic Harvester” [10], um outro meta-pesquisador. Outra aplicação integrada no BBMS é a pesquisa por artigos científicos, permitindo uma pesquisa rigorosa nas bases de dados mais importantes. Na segunda versão do BBMS, o BBMS++, além das melhorias gráficas, foi adicionado o acesso a aplicações bioinformáticas online, tais como a realização de “BLAST's” e “e- PCR”, entre outras. De modo a ter uma percepção da usabilidade, utilidade e eficiência do BBMS foi levado a cabo um inquérito, envolvendo cerca de 30 inquiridos, sendo os resultados finais muito satisfatórios. O BBMS++ está acessível em http://www.esa.ipb.pt/bbms
URI: http://hdl.handle.net/10198/4317
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