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Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/10198/3525

Título: Nova metodologia computacional de “Docking” proteína-ligando utilizando o AutoDock4
Autor: Abreu, Rui M.V.
Froufe, Hugo J.C.
Queiroz, Maria João R.P.
Ferreira, Isabel C.F.R.
Issue Date: 2009
Citação: Abreu, Rui M.V.; Froufe, Hugo; Queiroz, Maria João R.P.; Ferreira, Isabel C.F.R. (2009) - Nova metodologia computacional de “Docking” proteína-ligando utilizando o AutoDock4. In III Jornadas de Análises Clínicas e Saúde Pública de Bragança
Resumo: O principal objectivo do "docking" proteína-ligando é tentar prever como moléculas, tais como substratos ou potenciais fármacos, podem interagir com uma proteína alvo de estrutura 3D conhecida. O "docking" proteína-ligando pode ser utilizada para levar a cabo a análise de muitos ligandos potenciais e é uma ferramenta cada vez mais importante na descoberta de novos fármacos, uma vez que pode reduzir significativamente o número de compostos que numa fase posterior serão experimentalmente investigados. Contudo, esta metodologia requer uma grande capacidade de processamento computacional e muitas vezes são utilizados "clusters" de computador com Alto Desempenho Computacional (HPC- High Througoutput computing). Neste trabalho descrevemos um método para a construção de um "cluster" que pode ser utilizado para analisar um grande número de compostos utilizando o programa Autodock 4.0 [1] e uma plataforma HPC baseada no sistema operativo ParallelK.noppix (Linux) [2].
Arbitragem científica: yes
URI: http://hdl.handle.net/10198/3525
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