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Métodos eficientes para a detecção de padrões exactos (pattern-matching) em sequências biológicas

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Os algoritmos de detecção de padrões (pattern-matching), sejam exactos ou aproximados, são fundamentais na maioria das aplicações orientadas à análise de sequências biológicas. Nesta comunicação apresenta-se um novo algoritmo, denominado DC, desenvolvido para a especificidade do pattern-matching exacto, bem como uma análise comparativa do seu desempenho. Conclui-se que o desempenho do novo algoritmo supera, em média, o dos seus concorrentes, atribuindo-se o ganho de eficiência, sobretudo, à introdução de uma nova regra de filtragem denominada regra de compatibilidade.

Descrição

Palavras-chave

Pattern-matching Descoberta de padrões

Contexto Educativo

Citação

Deusdado, Sérgio (2010). Métodos eficientes para a detecção de padrões exactos (pattern-matching) em sequências biológicas. In IV Seminário de Engenharia Biomédica da ESTiG do Instituto Politécnico de Bragança

Projetos de investigação

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Editora

Instituto Politécnico de Bragança. Escola Superior de Tecnologia e Gestão

Licença CC