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Abstract(s)
O principal objectivo do "docking" proteína-ligando é tentar prever como moléculas,
tais como substratos ou potenciais fármacos, podem interagir com uma proteína alvo de
estrutura 3D conhecida. O "docking" proteína-ligando pode ser utilizada para levar a
cabo a análise de muitos ligandos potenciais e é uma ferramenta cada vez mais
importante na descoberta de novos fármacos, uma vez que pode reduzir
significativamente o número de compostos que numa fase posterior serão
experimentalmente investigados. Contudo, esta metodologia requer uma grande
capacidade de processamento computacional e muitas vezes são utilizados "clusters" de
computador com Alto Desempenho Computacional (HPC- High Througoutput
computing).
Neste trabalho descrevemos um método para a construção de um "cluster" que pode ser
utilizado para analisar um grande número de compostos utilizando o programa
Autodock 4.0 [1] e uma plataforma HPC baseada no sistema operativo ParallelK.noppix
(Linux) [2].
Description
Keywords
Pedagogical Context
Citation
Abreu, Rui M.V.; Froufe, Hugo; Queiroz, Maria João R.P.; Ferreira, Isabel C.F.R. (2009). Nova metodologia computacional de “Docking” proteína-ligando utilizando o AutoDock4. In III Jornadas de Análises Clínicas e Saúde Pública de Bragança